MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	GCT	2	6	35	40	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017204	AGG	2	6	78	83	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017204	AGG	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017204	T	6	6	2304	2309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017204	GAAA	2	8	2313	2320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017204	TTA	2	6	2328	2333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017204	T	6	6	2351	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017204	CAA	2	6	2403	2408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017204	A	7	7	5026	5032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017204	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017204	AGA	2	6	15573	15578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017204	GA	3	6	18097	18102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017204	TGC	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017204	T	6	6	21761	21766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017204	A	6	6	21819	21824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017204	AAAT	2	8	21844	21851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017204	A	6	6	21933	21938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017204	A	7	7	21968	21974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017204	TCC	2	6	23219	23224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017204	TAA	2	6	23232	23237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017204	CTA	2	6	23241	23246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017204	GAA	2	6	23262	23267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017204	TCA	2	6	23278	23283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017204	ACT	2	6	23303	23308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017204	AGG	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017204	TCTA	2	8	23372	23379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017204	A	6	6	23439	23444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017204	GAG	2	6	23461	23466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017204	TTTG	2	8	24023	24030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017204	A	6	6	25111	25116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017204	T	7	7	25143	25149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017204	A	7	7	25163	25169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017204	T	6	6	25174	25179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017204	ATTT	2	8	25196	25203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017204	TAA	2	6	25227	25232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017204	AGG	2	6	25246	25251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017204	TGGAT	2	10	25261	25270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017204	TAC	2	6	25350	25355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017204	GAA	2	6	25365	25370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017204	AAAGA	2	10	25371	25380	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017204	AG	3	6	25422	25427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017204	CT	3	6	25434	25439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017204	TA	3	6	25467	25472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017204	A	6	6	25478	25483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017204	ACA	2	6	25545	25550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017204	ATG	2	6	25604	25609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017204	TC	3	6	25921	25926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017204	TA	3	6	25968	25973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017204	AATC	2	8	26644	26651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017204	TACC	2	8	26775	26782	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017204	T	6	6	26844	26849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017204	CCA	2	6	26878	26883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017204	ACA	2	6	26897	26902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017204	TA	3	6	26920	26925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017204	TATGTG	2	12	26941	26952	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017204	T	7	7	26991	26997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017204	TCCT	2	8	27057	27064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017204	T	7	7	27064	27070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017204	A	7	7	27098	27104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017204	A	6	6	28484	28489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017204	T	7	7	28511	28517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017204	ATC	2	6	28774	28779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017204	GCC	2	6	28817	28822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017204	TC	3	6	30213	30218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017204	TAC	2	6	30260	30265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017204	AAAC	2	8	30300	30307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017204	TAAA	2	8	30345	30352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017204	A	7	7	30350	30356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017204	TCC	2	6	30990	30995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017204	TCC	2	6	31035	31040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017204	TAA	2	6	31055	31060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017204	TAT	2	6	31083	31088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017204	AT	4	8	31092	31099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017204	A	7	7	31112	31118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017204	TCT	2	6	31186	31191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017204	T	7	7	31191	31197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017204	TA	3	6	31235	31240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017204	ATC	2	6	31247	31252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017204	AAAAG	2	10	31263	31272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017204	AATG	2	8	31283	31290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017204	TTC	2	6	31297	31302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017204	ATA	2	6	31321	31326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017204	TAT	2	6	31343	31348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017204	TAAAT	2	10	31397	31406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017204	T	6	6	31421	31426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017204	ACA	2	6	31524	31529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017204	CCT	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017204	TA	3	6	31837	31842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017204	CT	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017204	TAT	2	6	31921	31926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017204	A	6	6	32357	32362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017204	ATTT	2	8	32382	32389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017204	TGG	2	6	32392	32397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017204	CTC	2	6	32430	32435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017204	TTAA	2	8	32468	32475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017204	A	6	6	32522	32527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017204	TACA	2	8	32557	32564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017204	ATT	2	6	32565	32570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017204	ATT	2	6	32589	32594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017204	CCT	2	6	32622	32627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017204	TGAT	2	8	32643	32650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017204	TAGT	2	8	32695	32702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017204	CTA	2	6	32725	32730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017204	A	7	7	35316	35322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017204	TCC	2	6	35323	35328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017204	T	6	6	35331	35336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017204	A	6	6	35346	35351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017204	T	7	7	35385	35391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017204	GTA	2	6	35465	35470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017204	GGC	2	6	35471	35476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017204	T	7	7	35511	35517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017204	TA	3	6	35528	35533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017204	A	6	6	35533	35538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017204	A	6	6	35592	35597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017204	TGT	2	6	35638	35643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017204	GAA	2	6	35666	35671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017204	TG	3	6	35735	35740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017204	AG	3	6	35801	35806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017204	ACC	2	6	35997	36002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017204	TCT	2	6	36040	36045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017204	TTTAT	2	10	36046	36055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017204	TCATA	2	10	36083	36092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017204	AAT	2	6	36096	36101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017204	A	6	6	36105	36110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017204	TTC	2	6	36135	36140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017204	TTTAAT	2	12	36155	36166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017204	ACTT	2	8	36237	36244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017204	CT	3	6	36855	36860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017204	TAG	2	6	36868	36873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017204	TAAT	2	8	36896	36903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017204	AT	3	6	36908	36913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017204	T	6	6	36954	36959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017204	ATGT	2	8	37182	37189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017204	T	7	7	37192	37198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017204	GGA	2	6	37218	37223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017204	TCCC	2	8	37690	37697	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_017204	TTAG	2	8	38181	38188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017204	AACT	2	8	38203	38210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017204	AAT	2	6	38216	38221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017204	ACT	2	6	38261	38266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017204	TAA	2	6	38267	38272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017204	GTTT	2	8	38318	38325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017204	AGTT	2	8	38351	38358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017204	AAT	2	6	38365	38370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017204	AAT	2	6	38377	38382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017204	TA	3	6	40491	40496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017204	CAT	2	6	40903	40908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017204	GATG	2	8	40912	40919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017204	AAAT	2	8	40957	40964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017204	ATTA	2	8	41043	41050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017204	T	6	6	42458	42463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017204	ATTG	2	8	42511	42518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017204	GA	3	6	45301	45306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017204	GAA	2	6	45954	45959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017204	TTA	2	6	46552	46557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017204	GA	3	6	47001	47006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017204	AG	3	6	47008	47013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017204	ATAA	2	8	47916	47923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017204	A	6	6	47922	47927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017204	GCAA	2	8	47932	47939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_017204	TA	4	8	47990	47997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017204	TA	3	6	48015	48020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017204	AGG	2	6	48023	48028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017204	ATAA	2	8	48612	48619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017204	ATA	2	6	48625	48630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017204	ATT	2	6	48636	48641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017204	TAA	2	6	48677	48682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017204	ATT	2	6	48695	48700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017204	TA	3	6	48719	48724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017204	A	6	6	48774	48779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017204	ATAA	2	8	48782	48789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_017204	TAA	2	6	49361	49366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_017204	GTT	2	6	49391	49396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017204	CAATA	2	10	49510	49519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_017204	A	7	7	49577	49583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017204	T	6	6	49596	49601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017204	A	6	6	49663	49668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017204	T	6	6	49707	49712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.